Facioがバージョンアップしてた

3D分子モデリング作成and可視化で便利なフリーソフトFacioが11月8日にバージョンアップしてました。
pdbやmol等の構造データを複数読み込んで編集したり、
作成した分子モデルを外部のGAMESSやTINKER等（別途準備が必要）に投げ入れて
分子軌道を量子化学計算する機能もあったりします。

分子の数が多いと描画と演算に時間がかかるので、
調子にのってタンパク質や長い核酸やナノチューブを表示するとフリーズします。
小さい分子から順に試してみたり、グラフィッククオリティの調整をするといいです。

http://www1.bbiq.jp/zzzfelis/Facio_Jp.html