Perl関連本のメモ【スルー推奨】

プログラミング bioinformatics Perl 並列計算機本 OpenMP

読了していないものの方が多い。金銭的に買えないものがある・・・Perlの参考書初めてのPerl作者: ランダル・L.シュワルツ,トムフェニックス,Randal L. Schwartz,Tom Phoenix,近藤嘉雪出版社/メーカー: オライリージャパン発売日: 2003/05メディア: 単行本購…

2009-07-23

CUDA SDK 2.3（私的なTIPSにつきスルー推奨）

並列計算機 GPGPU

CUDAのToolKit およびSDKの2.3がリリースされました。下記はリリースノートでフォーラムからの引用。 http://forums.nvidia.com/index.php?showtopic=102548 The CUDA Toolkit and SDK v2.3 are now released and available to all developers.A brief overv…

2009-06-30

設定がよくわかんない、窓の開発環境

Windows 並列計算機

WindowsノートPCのローカル環境でＭＰＩ使いたくて、VisualStudioを環境設定したけど、ライブラリの追加とかプロジェクトごとに設定するとか気付かないです…MPICHのディレクトリ構成がUNIX系と結構違う。設定後に開発環境の再起動あるいはセッションの再ログ…

2009-05-28

計算機が色々と不調

日記 Windows 並列計算機

計算用に使ってるラボのワークステーション。 Core i 7 かマザボと64bit Windowsの相性が悪いのか、動作がもっさりでまともに動作してくれません。起動に5分、ブラウザ開くとフリーズという状況。 ubuntuやFedora辺りはネイティブで64bitがさくさく動く…

2008-12-21

Cell B.E. クラスタの「はうとぅー」サイトがありました

並列計算機 PS3 Linux

昔、私もやっていたCell B.E.のクラスタについて「はうとぅー」を書いたサイトがありました。2007年にPS3×8台構成のクラスタを発表していたMITのGaurav Khanna先生のグループのようです。追試を行い方にはさんこうになるのではないでしょうか？実際にクラス…

2008-12-11

OpenCL 1.0 が批准されたらしい

並列計算機

OpenGLのスペルミスではありません。 OpenGLの規格を決めている団体Khronosグループが新しいクロスプラットフォーム対応の並列プログラミング標準規格を発表されました。ロイヤリティフリーで利用できるようで、CPU、GPU、Cell、DSP（（Digital Signal Proce…

2007-11-08

MPICH2を使ってみた

並列計算機 Linux

MPICHはプログラムを実行のたびにmachinefileを読みホストにアクセスするのに対し、MPICH2は先に各ホストでデーモンを起動させておき、その上でプログラムを実行するタイプ（LAMに似てる？）。色々と文献を調べると後継のMPICH2の方がMPICHより効率が良いら…

2007-11-07

MPIのベンチ(追記アリ)

Linux PS3 並列計算機

PS3 Linux で MPI を利用することは意外とあっさりできた。ディストリビューションが異なるnodeをつないでもディレクトリ構成さえ同じであれば問題なく通信できた。また、Yellow Dog Linux 5 の PS3 を 2、4 ノード用いた場合と Fedora7, Ubuntu 7.0.4 を別…

2007-10-29

Cell BE Cluster 好評稼働中

PS3 Linux 並列計算機

エラー続きだったのに、再設定したらあっさりとMPIの送受をしてくれた。Yellow Dog Linux 5.0 for PLAYSTATION 4台 Ubuntu 7.04 2台の2セット計6台が稼働した。残り2台をFedora7時期的にFedora8にするかもしれないが、ディストリごとにベンチマークとって、…